A governança da Rede Mulher Florestal está estruturada de forma transparente e participativa. No topo da organização está a Assembleia Geral, instância soberana responsável pelas aprovações estatutárias e pela eleição do Conselho Diretor (instância deliberativa) e do Conselho Fiscal (fiscalização contábil), compostos por voluntárias eleitas pelas associadas. A estrutura conta ainda com um Conselho de Ética (em estruturação) e apoio da Assessoria Jurídica, além da Secretaria Executiva, que coordena a execução das atividades por meio de oito Comitês Temáticos e quatro Grupos de Trabalho (GTs) estratégicos — impulsionando, na base, o engajamento contínuo das associadas Pessoas Físicas e Jurídicas.